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Wappen
(LK) = Landkreis
(S) = Stadt
(G) = Gemeinde
(SB) = Stadtbezirk
(Ot) = Orts-/Stadtteil
In Gold über einem erniedrigten blauen Wellenbalken ein fünfspeichiges schwarzes Mühlrad.
In die damalige Gemeinde Wutöschingen ist Ofteringen seit 1. Januar 1971 eingegliedert. Die neue Gemeinde Wutöschingen ist am 1. Januar 1975 durch die Vereinigung von Degernau, Horheim, Schwerzen und Wutöschingen gebildet worden.
Die krenkingische Herrschaft Wutental bestand ursprünglich nur aus den vier Orten Wutöschingen, Schwerzen, Willmendingen und Horheim mit den Höfen zu Lütisloh (= Horheimer Höfe). 1361 verpfändete Freiherr Johann von Krenkingen Gericht, Zwing und Bann über diese Dörfer an die Edlen von Hohenfels (aus dem Linzgau), die sie 1410 an die Ritter von Rümlang (aus dem Zürichgau) verkauften. Von diesen ging die kleine Herrschaft 1488 wiederum durch Kauf über an den Grafen Heinrich von Lupfen, Landgrafen zu Stühlingen. Nach Erlöschen des lupfischen Geschlechts gelangte sie mit dessen Erbschaft 1582 an die Erbmarschälle von Pappenheim. 1603 verkaufte Maximilian von Pappenheim, Landgraf zu Stühlingen, “die drey Flecken im Wuetenthal, als Eschingen, Schwertzin und Willmendingen, in sultzischer der Landgrafschaft Cleggaw hoher Oberkeit gelegen“ an den Grafen Karl Ludwig zu Sulz, Landgrafen im Klettgau (Bader, Urkunden). Unter der Verwaltung der den Sulzern Ende des 17. Jahrhunderts folgenden Schwarzenbergern kam auch Degernau zu deren Herrschaft Wutental. Beim Übergang an Baden im Jahre 1806 lag die Landeshoheit über Degernau, Schwerzen und Wutöschingen bei der schwarzenbergischen Landgrafschaft Klettgau, über Horheim und Ofteringen bei der fürstenbergischen Landgrafschaft Stühlingen.
Die neu gebildete Gemeinde Wutöschingen wünschte ein Wappen, das zum Ausdruck bringen sollte, einerseits die Anzahl der Ortsteile und deren Lage im Wutachtal, andererseits das einstige Vorhandensein einer Mühle in jedem der fünf Ortsteile. Dem trug das Generallandesarchiv mit seinen Entwürfen Rechnung. Das die Gemeinsamkeiten geographisch und historisch symbolisierende Wappen nebst der Flagge in den Farben Blau-Gelb ist der Gemeinde am 21. Januar 1977 vom Landratsamt Waldshut verliehen worden.